Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P58686 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
P58686 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P58686 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P58686 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P58686 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P58686 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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