Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms