Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms