Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms