Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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