Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmoP56726 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmoP56726 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SmoP56726 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms