Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp5P56399 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms