Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms