Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GemP55041 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GemP55041 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GemP55041 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms