Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn5P54830 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms