Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms