Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Map3k1P53349 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms