Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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