Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnfP51944 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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