Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MipP51180 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MipP51180 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MipP51180 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MipP51180 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MipP51180 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MipP51180 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MipP51180 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MipP51180 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MipP51180 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MipP51180 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms