Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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