Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms