Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CitP49025 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CitP49025 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CitP49025 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CitP49025 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CitP49025 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms