Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klf1P46099 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms