Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msh2P43247 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msh2P43247 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msh2P43247 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms