Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tac1P41539 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms