Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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