Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TfamP40630 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TfamP40630 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TfamP40630 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms