Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms