Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd1P40201 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms