Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf1P39428 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms