Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms