Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col18a1P39061 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms