Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms