Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn1P35821 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms