Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms