Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin2aP35436 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2aP35436 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms