Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpardP35396 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpardP35396 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpardP35396 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpardP35396 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms