Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms