Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp13P33435 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms