Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa2P31245 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms