Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms