Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sstr1P30873 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms