Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tacr1P30548 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tacr1P30548 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tacr1P30548 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tacr1P30548 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tacr1P30548 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tacr1P30548 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms