Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms