Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtgfP29268 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtgfP29268 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtgfP29268 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtgfP29268 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtgfP29268 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms