Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxrgP28705 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxrgP28705 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxrgP28705 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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