Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RxraP28700 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RxraP28700 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RxraP28700 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms