Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms