Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms