Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms