Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6aP27664 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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