Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms