Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CftrP26361 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CftrP26361 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CftrP26361 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CftrP26361 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CftrP26361 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CftrP26361 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CftrP26361 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CftrP26361 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CftrP26361 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CftrP26361 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CftrP26361 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CftrP26361 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CftrP26361 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CftrP26361 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CftrP26361 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CftrP26361 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CftrP26361 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CftrP26361 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CftrP26361 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CftrP26361 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CftrP26361 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CftrP26361 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms