Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms